结肠癌肿瘤特异性CD4+和CD8+ T细胞的免疫相关基因
这项研究通过下载TCGA数据库中结肠癌的相关数据,运用多种生物信息学分析方法,探究结肠癌肿瘤浸润的CD4和CD8 T细胞中的免疫相关基因,为结肠癌免疫治疗提供依据。
差异基因与富集分析结果:研究检测出83个基质相关差异表达基因(DEGs)和1270个免疫相关DEGs,其中79个重叠DEGs富集于39个生物学过程。还筛选出79个CD4 T 细胞相关基因和8个 CD8+ T细胞相关基因,如ELK3,且CD4 T细胞相关的ADAD1和DLG3与患者预后显著相关。
ceRNA网络与化学-基因相互作用结果:构建的ceRNA 网络中,发现了chr22-38_28785274–29,006,793.1–miR-106a-5p-DDHD1和chr22-38_28785274–29,006,793.1–miR-4319-GRHL1两个轴,可能分别与CD4和CD8+ T细胞浸润有关。此外,还预测出 CD4+ T 细胞有175个、CD8+ T细胞有9个化学-基因相互作用对。